星火燎原之势虽成，但林凡深知，若不及时清除潜藏的火种，整片草原都可能被反噬的火焰灼伤。他决定选择一个最具代表性，也最关乎民生的领域，作为深化改革的突破口，并以此为契机，锤炼队伍，震慑宵小。这个领域，便是与每个人息息相关的——医道。
契机源于一桩看似不大的事件。京城“济民堂”一位年轻医师，在查验官府配发的药材时，发现一批治疗风寒的草药，竟被掺入了大量外观相似却无药效的杂草。他立刻上报，却遭到上司斥责“多管闲事”。年轻医师愤而通过“驿路”的隐秘渠道，直接将证据送到了老周手中。
老周不敢怠慢，立刻呈报林凡。林凡震怒，下令赵虎暗中彻查。结果触目惊心：不仅“济民堂”，连部分官办药局、甚至供应军中的药材，都存在以次充好、偷梁换柱的现象。利益链条直指太医院下属的药材库以及几位背景深厚的皇商。他们利用采买、检验环节的漏洞，与太医院内部蠹虫、地方药材商勾结，形成了庞大的贪腐网络，罔顾人命，中饱私囊。
“国之血脉，民生所系，竟也成了他们敛财的工具！”林凡在书房内，看着赵虎呈上的铁证，面沉如水。他意识到，这已不仅仅是惠民政策执行走样的问题，而是整个医政体系从根子上烂掉了一部分。必须下重手，刮骨疗毒！
林凡没有立刻发作，而是精心策划了一场阳谋。他先是以内阁名义，下发了一道《整顿医药，惠泽苍生》的札子，宣称为了进一步提升惠民力度，朝廷将加大对“济民堂”体系的投入，并计划在天下各州府推广，同时宣布将建立更严格的药材采购、检验标准，并公开招标，择优选取皇商。
这道札子，如同在平静的湖面投入巨石。巨大的利益和严格的监管，让既得利益集团坐立不安。他们开始四处活动，打探消息，试图阻挠新标准的制定，或是想方设法让自己的人在新的招标中胜出。就在他们频繁动作、留下无数痕迹之时，林凡动了。
时机成熟，林凡联合宸亲王，将掌握的所有证据直接呈递御前。皇帝看着那些记录着肮脏交易、甚至涉及军中用药安全的账册和口供，龙颜大怒，立刻下旨，授予林凡全权处理此案。
是日，锦衣卫包围太医院及涉案皇商府邸。以药材库总管为首的数十名太医院官员、吏员被锁拿下狱，几家背景深厚的皇商被抄家。林凡以雷霆万钧之势，迅速清洗了太医院的核心腐败层，其手段之果决，令朝野侧目。
清除毒瘤只是第一步，更重要的是建立新的、健康的肌体。林凡借此机会，开始系统性地重建医政体系：
1. 成立“医药清吏司”：在工部下设立独立机构，总揽官药采购、检验、配送，与太医院（专注诊疗、研究）分离，形成制衡。首任主事，由那位敢于揭发问题的年轻医师破格提拔，老周兼任副职，负责流程设计与监督。
2. 颁布《大晟药典》与《成药标准》：组织太医及民间名医，编纂颁布首部官方《药典》，明确规定各类药材的性状、等级、炮制方法。同时，对几种常用成药（如金疮药、避瘟散）制定严格的《成药标准》，推行标准化生产。
3. 推行“药材溯源制”与“皇商考核淘汰制”：要求所有采购药材，需标明产地、采集时间、经手人。对皇商实行定期考核，不仅看价格，更重质量、信誉，不合格者立即淘汰。
4. 鼓励设立“医学堂”：仿照“实务讲习所”，在主要州府设立“医学堂”，招收民间有志从医者，传授标准医术、新药知识，并强调医德培育，为新的医疗体系储备人才。
此番医道革新，再次触及了庞大的利益集团。一些与倒台皇商有牵连的官员，或是担心改革之火燎原的保守派，在朝会上发出了质疑的声音，指责林凡“权柄过重，操切行事”，“动摇太医院百年建制”。
然而，林凡手握铁证，改革方案条理清晰，且深得皇帝支持（皇帝亦对太医院腐败危及自身健康深感忌惮），更兼此事占尽“惠民”、“救人”的道德高地，反对的声音显得苍白无力。
高拱再次保持了沉默。他私下对亲信言道：“林凡此举，虽手段酷烈，然太医院之弊，确需整顿。其所立新规，于国于民有利。此事……老夫不便多言。” 他的沉默，某种程度上默认了林凡在民生具体事务上的主导权。
就在医道革新初见成效之时，江南几位世家家主，竟联名向林凡呈递了一份“贺礼”——并非金银，而是几家信誉良好的江南药商的名帖和资质文书，并表示愿意遵循新规，参与朝廷的药材供应。
这份“贺礼”，姿态谦卑，却用意深远。他们不再对抗，而是表示“服从”，并试图融入新体系。林凡清楚，这是更高级别的挑战。他们拥有资本、渠道和经验，一旦让其深入核心，未必不能在新体系中找到新的寻租空间，甚至反过来影响、操控新体系。
“看来，未来的斗争，将是规则内的竞争，是效率、质量、信誉的比拼。”林凡对顾莲舟感叹，“这或许，才是真正考验的开始。”
经历又一场惊心动魄的较量，林凡回到府中。顾莲舟早已备好安神汤，看着他眉宇间的疲惫，心疼道：“夫君此番，又得罪了不少人。”
林凡接过汤碗，笑了笑：“不得罪他们，就要得罪天下百姓。这笔账，我算得清。”
这时，安儿（林怀瑾）拿着书本过来，好奇地问：“爹爹，太医真的会故意用坏药吗？先生教我们‘医者仁心’……”
林凡放下碗，将儿子揽到身边，认真解释道：“安儿，记住，无论是为官还是行医，心中都要装着‘责任’二字。权力和技艺本身无好坏，但若被私心所用，便会成为害人之器。爹爹整顿太医院，就是要立下规矩，让有仁心者能施展才华，让存恶念者无处遁形。”
安儿似懂非懂，却郑重地点了点头：“爹爹，我长大了，也想做能帮助别人、立下好规矩的人。”
看着儿子清澈而坚定的眼神，林凡心中涌起一股暖流。他所做的一切，不正是为了给下一代创造一个更清明的世界吗？
破立之间，医道得以革新。林凡再次展现了他不仅善于打破旧世界的沉疴，更善于建设新世界的秩序。然而，他深知，旧的利益集团正在学习以新的方式生存，未来的道路，将是规则与智慧更为激烈的碰撞。他必须时刻保持警惕，不断优化自己创造的体系，方能在这时代的洪流中，立于不败之地。