夕阳的余晖洒在城市的天际线上，小霞望着那只体型稍大的妙蛙种子，轻声问道：小智，我们该怎么安置它呢？
小智温柔地抚摸着妙蛙种子翠绿的背脊，仿佛能读懂它的心事：我知道你既想在这座城市生存，又渴望找到一个真正理解你的训练家。你害怕再次被抛弃，但我向你保证，这次一定会不一样。他的声音坚定而温暖，我们会为你找到一个完美的家，一个永远爱你的家人。
妙啊妙啊...妙蛙种子发出低沉的回应。
当小智转身走向房车时，他回头露出灿烂的笑容：相信我，你会喜欢这份礼物的。妙蛙种子望着小智渐行渐远的背影，眼中闪过一丝不舍。没有啊，没有啊...它轻声呢喃着。
君莎小姐走上前来，温柔地安慰道：别担心，小智为你安排的是一位心地善良的女孩。她一定会好好照顾你的。
就在这时，一阵轮椅的轻响打破了黄昏的宁静。一个坐在轮椅上的女孩兴奋地问道：爸爸，这就是你要给我的惊喜吗？它在哪儿呀？
很快你就会知道了，小雪。雷博士神秘地笑了笑。
当遮盖布被掀开的瞬间，妙蛙种子出现在小雪面前。女孩惊喜地睁大了眼睛：天啊！太可爱了！她毫不犹豫地张开双臂，给了妙蛙种子一个温暖的拥抱。
妙蛙种子身体微微一僵，这是它第一次如此真切地感受到人类纯粹的善意。那种温暖如同涟漪般在它心中荡漾开来。晶莹的泪珠从它眼中滑落——这是它等待了太久太久的关爱。
你好啊！小雪甜甜地笑着。妙蛙种子用藤鞭紧紧回抱住她，仿佛找到了命中注定的伙伴。在这个阳光般明媚的女孩怀里，它终于感受到了家的温暖。
夕阳的余晖洒在废弃的游乐场上，将锈迹斑斑的摩天轮镀上一层血色。小智站在旋转木马旁，皮卡丘警觉地竖起耳朵，空气中弥漫着令人不安的气息。
小智，你为什么要这样做呢？小茂靠在断裂的栏杆边，指尖无意识地摩挲着精灵球上的裂痕。远处传来铁皮被风吹动的嘎吱声，像是某种不祥的预兆。每个人都有自己的路要走，不是所有人都能像你一样......他的声音突然哽住，目光落在小智被绷带缠着的右手上——那是上周在发电厂留下的伤痕。
当小茂的目光落在小智身上时，他的眼神明显黯淡了下来，仿佛透过挚友看到了某个不愿回忆的雨夜。别太在意我的事，他勉强挤出一丝微笑，却让左脸的伤疤显得更加狰狞，过去的就让它过去吧。旋转木马的彩灯突然闪烁了几下，投下诡异的阴影。
与此同时，在游乐场地下三十米的阴暗排水系统中。
boss，东西到手了。神奇宝贝猎人首领单膝跪地，双手捧着一块泛着诡异黑光的矿石。浑浊的污水在他们脚边流淌，几只超音蝠被惊得四散飞逃。首领用戴着黑手套的手指把玩着矿石，嘴角扬起一抹阴冷的笑容：真是讽刺，如此珍贵的暗影之石居然藏在这种肮脏的下水道里。矿石表面的纹路突然亮起紫光，映照出墙壁上那些被刻意掩盖的古老符文。
这...这不可能！一位戴着裂痕眼镜的博士踉跄后退，撞翻了生锈的检测设备，我们的量子探测仪完全没有检测到这里的能量波动！他的助手惊恐地发现，检测仪器的指针正在疯狂旋转，最终地一声炸成了碎片。
哼，你们这些书呆子永远不懂。首领冷笑着打了个响指，阴影中走出双眼泛着红光的电击魔兽，让它给你们演示下什么叫真正的力量！电击魔兽，使用十万伏特！
刹那间，整条隧道剧烈震动，污水逆流而上。一股令人窒息的黑暗能量从矿石中喷涌而出，化作无数扭曲的鬼影。那是由百年战争积累的贪婪与怨恨凝聚而成的邪恶力量，源自这片曾经被传说宝可梦的怒火焚烧过的土地。墙壁上的符文开始渗出黑色液体，逐渐组成一张狞笑的人脸。
首领粗暴地从矿石上掰下一小块碎片，随手抛向电击魔兽。只见电击魔兽的皮毛瞬间变成紫黑色，背部的导电器官暴涨三倍，狂暴的能量在它体内肆虐，将周围的金属全部磁化悬浮起来。它发出不似生物的嚎叫，一爪撕开了三米厚的混凝土墙。
就在电击魔兽即将彻底失控之际，一道裹挟着青色光芒的从天而降，快龙的身影在爆裂的电流中若隐若现。伴随着震耳欲聋的撞击声，电击魔兽被重重砸进地下，形成一个直径十米的陨石坑。
boss，这个废物怎么处理？戴着防毒面具的手下踢了踢抽搐的电击魔兽，它的身体正在以肉眼可见的速度腐烂。
首领看都不看地挥挥手，黑色披风扫过满地仪器碎片：扔进净化池，连这种程度都承受不了的东西...他突然停顿，矿石在他掌心发出刺耳的尖啸，不配见证新世界的诞生。
他转身望向头顶渗水的天花板，仿佛能穿透层层岩壁看到地面上的少年，眼中闪过一丝阴鸷：继续监视那个带着皮卡丘的小鬼，我要知道他每次心跳的频率。随着他的话语，矿石中浮现出小智战斗时的全息影像，画面定格在那顶被雷电劈中却依然闪亮的帽子。
在火箭队的秘密基地中，昏暗的灯光下，三人组正围坐在会议桌前。喵老大慵懒地趴在桌上，尾巴有节奏地轻轻摆动。
他们也在收集那个东西吗？小次郎压低声音问道，眼中闪过一丝不安，看来那个古老的预言真的要应验了...
喵～什么预言啊？喵老大竖起耳朵，好奇地歪着头。
真鸟推了推眼镜，镜片反射出一道冷光：让我来给你们详细说明吧。根据我们最新获得的情报，这块神秘的黑色矿石被称为负能量结晶
她展开全息投影，继续解释道：这个世界由光明与黑暗共同构成。无论是守护世界的神职者，还是维系神奇宝贝世界的地脉能量——生命、海洋、天空、大地，都遵循着这个法则。但光明之后必有阴影，在无尽的黑暗中，孕育出了无数黑暗系的宝可梦。
投影画面切换，显示出各种形态的黑暗宝可梦。它们诞生于人类最原始的负面情绪，比如黑暗诺基亚，就是傲慢的化身。
真鸟关闭投影，神情凝重：目前我们掌握的关键线索是，负能量结晶能够赋予神奇宝贝惊人的力量，但同时也会对它们的身体造成巨大负担。这种矿石本该只存在于传说中，没想到竟然会在这座城市的地下出现——它是由人类长期积累的负面能量凝聚而成的。
喵...原来是这样...喵老大的瞳孔微微收缩。
武藏猛地站起身，信誓旦旦地说：我们一定会把它夺回来！
坂木老大低沉的声音从阴影中传来，那个东西太过危险，难以控制。你们的任务是继续监视小智，我要掌握他的一举一动。他的目光如鹰隼般锐利，记住，这是最高优先级的任务。
是
出言那些事，我们就在这里先睡一下吧。天也暗下来了，没办法。太累了，就在这一坐旅馆上休息吧，可是这旅馆一看就很贵。要不没事，小智拿出了一张卡。进去吧。
好好的休息一下吧。
而在另一边。就是这里的吗？凤王来到这座城市的上空。诺基亚从海中一跃而起我。千年未见啊，凤王。是啊。那东西居然再次出现了。
凤王和洛奇尔一直盯着坐着城市下面的一座东西。黑暗结晶。没想到这里还有当年的残余。没有被清理干净。
阿尔宙斯大人居然。没有清理干净不？不是阿尔宙斯大人不清理干净是他也无能为力这个东西。需要神之使者。常年亲你。你应该知道当年的事吧。是啊，诸神的黄昏又何止？是这样。
我们只能保护最后的一位神之使者，或者让他繁衍子嗣。否则真的是让最后一位神之使者断了传承之后，天地只能走向毁灭。
接下来我要对这座城市进行审判。那么。小镇那边三圣兽已经被我调回来。那边只有。手下的嫡系吧。火焰鸟。
你们居然会在这里超梦，是见过凤王和洛奇亚的。你居然会在这里，你不是跟小志在一起吗？难道没有我和小智还是在旅行，只不过是找了一些东西罢了，原来是这样。
你们这是。以你的实力应该感应到这座城下的一所。那个东西吧。你说的是那个黑暗的本源，没错，这应该是阿尔宙斯的那个碎片之一。不过是黑暗的碎片。当年那一战，这东西却没有跟着一起消失。
麻烦你保护好小只。我会让三圣兽在暗中支援，毕竟他们也要维持这座大阵。
不需要我一个人都行，谁敢伤害小智，我就让他尝尝我的厉害。
而在另一边，早上好啊，小智。嗯，超梦，你居然回来了。小智好奇的看向超梦，找到你需要的东西，超梦只是点点头。这东西应该只有你能帮我。居然是超进化的力量，你从哪找到一个很古老的遗迹？
这应该是其中的一个碎片，其他的碎片你是感应不到吗？如果你让我太远，我是感应不到。
这时候超梦也是缓缓的陷入了沉睡，我需要休息，这次我耗费太大的力量。我需要休息一会儿。知道了。因为超梦并没有说接下来要做什么，因为他要蓄积力量，保护好小智。
少爷。你居然会在这里！小智惊讶的看见这位大叔。接下来是。好。我知道了。没想到你居然在这里。小霞也认出当初是小智救的那一位大叔。
这是。联盟商会。的所有的一个月的清单，你看一下好的联盟商会这样玉龙度差点没金要下吧？联盟商会是你的财产。
怎么了？
小茂问道。
居然还不知道联盟商会。我的老天爷呀。上次倒立跟小智发生了什么，这么大的组织居然是小智的财产。
没想到。这最大的。财阀居然会是小智。
小茂也头疼啊。看一下眼前的少年。儿时的玩伴，变成了自己要追逐的对象了。
小茂只是叹了口气。唉，这就是天才的差距，就这时外面有人喊着火了，怎么回事？回禀少爷。前方的一个小。仓库着火了。
要不要我派人去灭了那个火焰？那就谢谢了。毕竟我看那边应该很多人都很着急吧。这时小智。the卡密龟也出来了，卡米卡米，你要带着杰尼龟吗？可以正好把它们历练一下吧。好久不见的小智张博士，我希望杰尼龟的精灵球剩下的五只吗？那么你得拿五只精灵给我换，我把喷火龙。鲤鱼王。大嘴雀。快龙。妙蛙种子。就交给你了。当大木博士听到这些宝可梦时。
可以，我马上给你交换过来。
卡咪卡咪，好久不见了，是老大。
这火太大了。里面还有人当小智，感觉到里面居然还有人时，卡米龟，卡米卡米交给我。
我也来帮忙。水箭龟使用求雨。
我也来。上吧，宝石海星使用水泡。太好了，火势终于稳定下来了。这伙食有点大呀。天空的水蒸气马上就会没了。
黑暗诺基亚。使用。用水泡你也来帮忙吧。当众人看见居然是传说中的神兽。我也来诺基亚使用水炮。又一只神兽，两只洛奇亚，还有一只闪光洛奇亚，这些少年到底是什么来历？
随着人员被救出来，玫瑰和吉尼龟从火场中冲出来。你没事吧？我没事，谢谢你们。众人看见小女孩被救出来时。全力灭火。
就你们啊，不用谢，你应该谢谢他。卡密龟卡米卡米。
报告队长，最终的人员，我们抓住吧。你居然在仓库里玩火。又是你们火箭队。火箭队三人组变成了拉头那个。看他们也扔走了，那我们。就走了。谢谢你帮忙。不客气，君莎小姐。