启明号悬停在暗影星域上空，舰桥内所有人的目光都锁定在祭坛上的身影——那是一张曾出现在星核文明古籍中的面孔，银色长袍上绣着早已失传的星核符文，手中握着的黑色晶体，正是能唤醒暗影族的“暗影源晶”。
“墨渊！你不是在三万年前就随暗影族一起被封印了吗？”云航的声音带着难以置信，星核刃的三色光芒因愤怒而剧烈跳动。古籍记载，墨渊曾是星核文明的高阶战士，却因渴望更强大的力量，与暗影族勾结，最终被星核守护者封印在暗影星域。
墨渊缓缓转身，脸上带着扭曲的笑容，眼中闪烁着与暗影能量同源的黑光：“云航，没想到星核文明的传承，竟然落到了一个毛头小子手里。三万年前的封印，不过是让我和暗影族沉睡罢了，如今有了暗影源晶，我不仅能唤醒它们，还能让整个星尘航道成为暗影的乐园！”
他举起暗影源晶，黑色能量顺着祭坛的纹路蔓延，周围的暗影族黑影瞬间变得凝实，口中发出刺耳的嘶吼，向启明号扑来。“小雅，带领星刃小队拦截暗影族！我去阻止墨渊！”云航纵身跃出战舰，星核刃的光刃斩碎迎面而来的黑影，径直冲向祭坛。
小雅立刻下令，星刃小队驾驶小型战机，在暗影族中撕开一条通路，星核步枪射出的银白色子弹带着星辰意志，能直接驱散暗影能量。林野更是驾驶战机冲到最前方，将星核刃固定在战机炮口，射出一道金色光刃，瞬间清空一片暗影族。
云航冲到祭坛前，星核刃直劈墨渊手中的暗影源晶。墨渊侧身躲避，同时挥动长袍，黑色能量化作利爪，抓向云航的咽喉。“星核文明的力量，在暗影面前不过是蝼蚁！”墨渊的声音带着嘲讽，黑色能量不断从暗影源晶中涌出，祭坛周围的暗影族越来越多。
云航展开星辰意志，三色光罩挡住黑色利爪，星核刃注入本源之力，劈向祭坛的基座：“你背叛了星核文明的使命，今天我就要让你为自己的行为付出代价！”光刃击中基座，祭坛剧烈震动，黑色纹路瞬间黯淡，暗影族的行动也迟滞了一瞬。
“没用的！”墨渊狂笑起来，将暗影源晶按在祭坛中心，“暗影族已经苏醒，星尘航道的意志很快就会被吞噬，到时候没有人能阻止我！”
就在此时，艾莉丝驾驶星澜舰赶来，星澜圣晶的蓝色光芒在舰首汇聚，一道巨型光柱直轰祭坛：“云航，我来帮你！星澜能量能克制暗影能量！”光柱击中祭坛，黑色纹路寸寸崩裂，暗影源晶的光芒也变得微弱。
墨渊脸色骤变，转身想带着暗影源晶逃离，却被云航拦住去路。“哪里跑！”云航的星核刃泛起星辰意志的光芒，光刃如同流星般划过，斩断了墨渊握着源晶的手臂。暗影源晶掉落在祭坛上，黑色能量瞬间紊乱。
“不——！”墨渊发出凄厉的嘶吼，失去源晶的支撑，他体内的暗影能量开始反噬，身体逐渐被黑影吞噬，“我不会就这么失败的，暗影族会回来的！”最终，墨渊彻底化作一道黑影，消散在暗影星域中。
云航捡起暗影源晶，将星辰意志注入其中，黑色能量逐渐被净化，源晶化作一颗普通的晶体。周围的暗影族失去能量支撑，纷纷消散，暗影星域的黑色也开始褪去，露出原本的星光。
艾莉丝走上前，看着逐渐恢复的星域，松了口气：“总算解决了，没想到墨渊竟然还活着。”
云航摇头，将净化后的晶体收好：“暗影族的威胁虽然暂时解除，但我们不能掉以轻心。以后星尘航道和星澜星系要加强戒备，防止类似的危机再次发生。”