当林深再次睁开眼睛时，发现自己躺在浮空城的医疗舱中。他的身体虚弱无比，属性面板上显示着惨烈的状态：【生命值：10\/1000】【防御值：10%】【精神值：20%】，生命能量也只剩下寥寥无几的【5\/100】。身旁的生命之树黯淡无光，树叶枯黄，仿佛随时都会死去，【生命之树耐久度：15%】。
契约兽们也都受了重伤，熔岩灵尊身上的火焰变得微弱，霜狱冰龙的鳞片布满裂痕，雷暴战偶的机械身躯多处破损。林深挣扎着坐起身，心中充满了愧疚和不甘。“都怪我太轻敌，差点让大家丢了性命。”他自责地说道。
然而，林深并没有被失败打倒。他深知，在这个残酷的求生世界里，只有不断变强，才能守护自己的家园。他开始利用交易系统，用仅存的资源换取恢复药剂和修复材料。同时，他也在思考着如何提升自己和契约兽的实力，以及如何升级浮空城的防御。
在恢复身体的过程中，林深发现了一个惊人的秘密。他在吸收熵暗之力时，虽然承受了巨大的痛苦，但也意外地获得了一种新的能力——【熵暗同化】。这个技能可以让他在一定时间内同化周围的熵暗之力，转化为自己的力量，但同时也会对身体造成一定的负担。
林深决定先从升级木屋开始。他将收集到的稀有材料和雾能资源全部投入到木屋的改造中。木屋的外观逐渐发生变化，原本简陋的木屋变得更加坚固和高大，墙壁上镶嵌着闪烁着幽光的雾晶，屋顶上覆盖着一层特殊的金属材料，能够抵御强大的攻击。
木屋内部也进行了全面升级，设置了多个功能区，包括修炼室、储物室、实验室等。修炼室中，林深布置了特殊的阵法，可以加速修炼速度；储物室采用了空间压缩技术，能够容纳更多的物资；实验室则配备了先进的仪器，方便他研究各种材料和技能。
在升级木屋的同时，林深也没有忘记提升契约兽的实力。他用生命果实和珍贵的材料为契约兽炼制了特殊的药剂，帮助它们突破等级上限。熔岩灵尊突破到了【LV.39】，学会了新技能【熔炎爆裂】，可以释放出巨大的熔岩爆炸；霜狱冰龙达到了【LV.42】，掌握了【极寒冰狱】，能够制造出一个强大的冰狱领域；雷暴战偶晋升为【LV.44】，领悟了【雷霆审判】，可以召唤出强大的雷霆之力进行审判。
随着木屋的升级和契约兽的变强，浮空城的防御也得到了极大的提升。混沌法则炮台经过改造后，威力更加强大，能够发射出更加强大的【混沌裂空弹】；生命之树在林深的精心照料下，也逐渐恢复了生机，重新绽放出治愈的光芒，并进化出了【生命虹吸】技能，可以吸收周围的生命能量来恢复自身的耐久度。
一切都在朝着好的方向发展，但林深知道，危险并未解除。熵暗之主的威胁依然存在，他必须继续变强，才能在即将到来的决战中取得胜利。于是，林深带着契约兽，再次踏上了搜寻物资、打怪升级的征程...