而在太子的领导之后，对于大宗贸易领域中的信用凭证等改革措施，对于现在的大明来说是很重要的，这点朱载坖是很清楚的，在太子的领导之下，首先在海关贸易中推动使用朝廷所发行的各种信用凭证这点是极为重要的，朱载坖的意图是很明显的，就是在大宗贸易中用朝廷银行所发行的各种信用凭证作为结算的依据，这样打击这些豪商掌握大量的货币，有意制造钱荒来获取利益。
在之前的大明，也曾经多次出现过钱荒，但是当时的朝廷，更多的是采取强硬的处理办法，对于这些商人，朱载坖一向是毫不留情的，该动用暴力手段的时候绝对不和他们废话，掀起大狱，加以惩处是经常的事情，但是这次太子却变换了方式来处理，这也是很正常的事情，现在的朝廷财政还是比较宽裕的，同时朱载坖的内承运库也有丰富的黄金储备，朱载坖一直在收储黄金，不管是倭国还是大明内地的黄金，朱载坖都大量的收储，储存于内承运库内。
朱载坖很清楚这些黄金的重要地位，而这次太子也准备利用这些黄金来建立大明的信用货币体系，而在朝廷准备处理这些事情的时候，叶尔羌汗国的使团也抵达了京师，叶尔羌汗国之前也确实是向大明朝贡过，但是之前的朝贡更多的是为了经济利益，现在大明在西域加紧扩张，对于叶尔羌汗国来说是极为有威胁的一件事情。
为了打听大明朝廷对于叶尔羌汗国的看法，所以他们特地遣使大明，朱载坖自然是知道他们的用意的，无非就是想探听大明朝廷对于叶尔羌汗国的态度，毕竟现在大明在西域大军征讨，卫拉特四部显然不是大明官军的对手，而一旦大明官军控制了天山之后，叶尔羌汗国自然就危险的。
而且叶尔羌汗国一路东来，也看到了大明官军正在源源不断的向西增援，同时朝廷的各种物资也在也在源源不断的向西部调运，从京师和西北各省的直道上，都是源源不断的车马，这些都带给叶尔羌使臣极大的震撼，在这种情况下，叶尔羌使臣来到京师将礼部递交了国书。
礼部尚书陈经邦和分管外事的大学士罗万化在收到叶尔羌的国书之后，赶紧向朱载坖呈报相应的情况，这次叶尔羌汗国所呈递的国书和进贡的物品确实是十分的丰厚的，不光有各种牲畜，还有金银和西域的各种物品，同时国书之中也是极尽谦卑之词，重申叶尔羌汗国和大明的朝贡关系，希望能够得到大明的庇护。
朱载坖看了之后对罗万化说道：“此岂非乞缓师表乎？”
朱载坖当然知道叶尔羌汗国的意图，这次遣使大明，一来是想查探大明是否的态度，二来是缓和和大明的关系，这点事极为重要的，朱载坖的态度自然是仍旧不变的，就是要对叶尔羌汗国用兵，一举荡平西域，为大明解决西域的边患，但是叶尔羌毕竟是卑辞请款，大明作为天朝上国，还是有仔细应对的，要为出兵做好法理解释才行，否则的话就是兴不义之师，这是大明必须要避免的事情。
所以在朱载坖的指令下，礼部对于叶尔羌汗国遣使一事也做了回应，对于叶尔羌汗国再次朝贡，礼部认为迎道予以拒贡，因为叶尔羌汗国上一次进贡是在武宗时期，无故不贡，是为大不敬也，同时之前叶尔羌汗国在西域的扩张也是对于大明的公然挑衅，攻略大明的藩属，拒不朝贡，和北虏相勾结，桩桩件件，都是大明所决不能容忍的。
所以大学士罗万化和礼部尚书陈经邦具奏朝廷，认为叶尔羌汗国狂悖无礼，久失朝贡，同时袭扰大明藩属，更与北虏相勾结，罪深恶重，断不能容，之所以现在向大明朝贡那是因为大明在西域囤积重兵，叶尔羌汗国担忧罢了，对于这种情况，礼部认为应该加以绝贡。
朱载坖将罗万化等人的奏疏下内阁以及朝廷商议，对于此事，朝廷上下其实都是很清楚的，之所以礼部这次会对叶尔羌的进贡要求予以绝贡，是因为大明已经准备动手了，朝廷为此调动大军，囤积粮秣，已经砸下去数以百万计的钱粮了，这个时候已经是箭在弦上不得不发了，叶尔羌无论态度多么端正，大明攻灭其的决心都是不会动摇的。
不光内阁以及各部院对此事反应强烈，各级将校们对于此事也是极为愤慨的，不光是西北诸将纷纷上疏，要求严惩叶尔羌，整顿大明的宗藩秩序，以彰显大明的国威，军机处的诸位军机大臣们也纷纷上疏，要求立即用兵，对于朱载坖来说，用兵是自然要用兵的，朝廷已经调动了这么多的兵马钱粮，怎么可能因为叶尔羌朝贡就此罢休呢？
这点朱载坖是很清楚的，所以朱载坖御批同意了礼部的结论，对于叶尔羌的朝贡予以绝贡的惩罚，同时明确昭告天下，要对叶尔羌予以征讨。
朱载坖在诏书中历数叶尔羌汗国的种种罪过：“第一，朝贡失期，无故不贡，对大明天子大不敬。”
第二，攻我属夷，灭我藩国，叶尔羌汗国是由原来的亦力把里演变而来的，两者均属于察合台汗国后裔政权，共享王统和文化特征，但叶尔羌汗国更侧重于南疆地区的治理。?叶尔羌汗国与亦力把里并非并立关系，而是后者分裂后的产物。但是在叶尔羌取代亦力把里的过程中，并没有得到大明朝廷的准允，这是对于大明宗主国地位的极大挑衅，还有就是叶尔羌汗国在做大之后，袭扰哈密等地，直接威胁大明的西北边疆。
第三，勾结北虏，谋患中华，叶尔羌汗国和卫拉特部甚至是中亚的蒙古汗国都是有很深刻的交往的，在这种情况之下，对于大明也构成了威胁，所以必须要予以征讨。